ZFCT ni chombo cha kimahakama ambacho kinafanya kazi chini ya Wizara inayohusika na Biashara, ambayo inachukua jukumu la usimamizi juu ya Mahakama, ni wazi utawala wa utawala wa mahakama hurahisisha utekelezaji wa kusikiliza na kuamua rufaa zinazotokana na utaratibu na maamuzi kutoka kwa Tume ya Ushindani wa Haki na mamlaka nyingine za udhibiti zinazosaidia ZFCT kuhakikisha uwajibikaji na kuboresha utendaji kazi kulingana na dira na dhamira yake. Muundo wa shirika la ZFCT ni kama ifuatavyo:

Mahakama

Baraza hilo linaundwa na Mwenyekiti aliyeteuliwa na Rais wa Zanzibar na wajumbe wengine wanne wanaoteuliwa na Waziri mwenye dhamana ya Biashara.

Mwenyekiti aliyeainishwa chini ya kifungu cha 26 (2)(a) cha sheria ya Ushindani Halali wa Biashara na Kumlinda mtumiaji, Sheria namba 5 ya mwaka 2018. Wajumbe wengine wanne ambao huteuliwa na Waziri kwa kuzingatia jinsia.

Wajumbe huteuliwa na Mh. Waziri wa Biashara na Maendeleo ya Viwanda. Katika uteuzi wa wajumbe chini ya kifungu kidogo cha (2)(a) cha kifungu hiki, Waziri atateua watu wenye elimu na uzoefu katika fani ya sheria, uchumi, biashara, fedha na fani nyengine zinazohusiana na hizo kutoka sekta ya umma na binafsi.

Wajumbe wa Baraza, isipokuwa Mwenyekiti, watatumikia ofisi kwa kipindi cha miaka mitatu na wanaweza kuteuliwa tena kwa kipindi chengine kimoja, 

Majukumu ya kiutawala ya Baraza kutekelezwa na Mrajis ambaye huteuliwa na Mh. Waziri wa Biashara na Maendeleo ya Viwanda. Mrajis atafanya kazi zake zote za utawala za Baraza kama zilivyoainishwa chini ya Sheria hii na kanuni zake, akisaidiwa na watumishi wengine wa ngazi mbali mbali wakiwemo wakuu wa Idara, Vitengo, Divisheni na Maafisa.